Nukleinska kislina je zaprta v nekakšno posodo ali oblogo, imenovano kapsida, in je sestavljena iz ponavljanja beljakovinskih podenot, imenovanih kape, ki nastanejo zaradi ponavljanja enega, dveh ali več beljakovin. Pri papiloma virusu je na primer kapsida sestavljena iz več kopij dveh različnih proteinov, L1 in L2; prvi, bolj obilen, ima sposobnost samoagregacije in tvorjenja virionov brez nukleinskih kislin (je zelo imunogen in se zato uporablja kot osnova za proizvodnjo cepiv).
The jedro virusu zagotavlja sposobnost izvajanja procesov razmnoževanja in rasti, kapsid pa daje obliko in stabilnost virusnemu delcu, ščiti njegov genom in je pomemben za infektivnost (zahvaljujoč prisotnosti struktur proti receptorjem).
Skupaj kapsid in nukleinska kislina tvorita nukleokapsid.
V naravi obstajajo virusi, ki jih tvorijo samo nukleinske kisline in kapsida, zato se imenujejo "goli virusi"; bakteriofagi so primer golih virusov. Obstajajo tudi drugi virusni delci, ki poleg kapside predstavljajo še zunanjo membrano, imenovano perikapsid, peplos ali plašč (ovojnica), ki izvira iz plazemske membrane gostiteljske celice in je kot taka sestavljena predvsem iz fosfolipidov, pa tudi iz polisaharidov in beljakovin (običajno glikoproteinov). Virusi s pericapsidom se imenujejo "virusno obložen"in imajo na splošno tudi proteinsko strukturo, imenovano matriks ali obloga, ki se nahaja med kapsido in perikapsidom.
Obloženi virusi - zahvaljujoč pericapsidnim fosfolipidom - lažje prodrejo v občutljive celice in zmanjšajo imunski odziv gostitelja; adenovirus, odgovoren za simptome konjunktivitisa in parainfluence, je primer obloženega virusa, tako kot vsi drugi virusi virusi, ki okužijo evkarionte.
Virusni kapsid lahko običajno prevzame dve različni konformaciji, za katero je značilna ena struktura ikosaedrskega tipa ali spiralno.
Ikosaeder je trdna snov, sestavljena iz enakostraničnih trikotnikov, ki ima 12 točk, 20 obrazov, sestavljenih iz enakostraničnih trikotnikov, in 30 robov, ki ustrezajo stranicam trikotnikov, medtem ko so točko stičišča strani. Ta kristalografska struktura izhaja iz zveza uravnava več beljakovin; vsakega od njih imenujemo monomer in ti monomeri se lahko pridružijo pet do pet tvorijo pentone ali - pri večjih virusih - 6 do 6 tvorijo tako imenovane eksone. Združenje pentonov in eksonov tvori eikozaeder, znotraj katerega se nahaja genetski material.
V drugi strukturni tipologiji kapside, imenovani spiralno, so posamezni monomeri razporejeni v spiralo okoli osi (beljakovine so razporejene kot stopnice spiralnega stopnišča) in tvorijo votel valj, ki obdaja nukleinsko kislino.
Virus tobačnega mozaika je tipičen primer virusa spiralne strukture, medtem ko ima papiloma virus ikosaedrično strukturo. Obstajajo tudi virusi, pri katerih kapsida nima simetrije in ima mešano morfologijo (na primer virus HIV, ki je sestavljen iz ikozaedrične kapside in nitastega jedra nukleinske kisline).
Razvrstitev virusov
Vsak virus je identificiran po vrsti, rodu in družini. Na primer, če vzamemo virus HIV, vrsta označuje splošno ime mikrogranizma, to je virusa pridobljene imunske pomanjkljivosti ali natančneje HIV. Ta virus spada v rod lentivirus (tj. S počasnim ciklom rasti) in v retroviridae družina (retrovirusi so virusi z replikacijskim ciklom, za katerega sta značilni dve obliki nukleinske kisline, ki predstavljata encim, imenovan reverzna transkriptaza, ki lahko izvede reverzno transkripcijo in pretvori virusno RNA v DNA).
Vsaka virusna vrsta se nato opiše na podlagi strukture (velikost, morfologija in vrsta nukleinske kisline), vrste razmnoževanja (jedrska ali citoplazemska), gostiteljske celice (živali, glive, rastline ali bakterije), tropizma tkiva ali organ in vrsto prenosa (fekalno-oralni, parenteralni itd.).
Protivirusna cepiva
Protivirusna cepiva lahko sestavljajo ubiti (inaktivirani), oslabljeni virusi (ohranili so sposobnost razmnoževanja, vendar so izgubili velik del svojega patogenega potenciala) ali virusne podenote (cepiva nove generacije nastanejo na primer iz virusnih perikapsidnih beljakovin, npr. ki lahko spodbudi pasivno imunost). Priprava nove generacije je cepivo proti hepatitisu B, ki temelji izključno na kapsidnem glikoproeinu virusa HBV.
Drugi članki o "Strukturi in razvrstitvi virusov"
- Virus
- Razmnoževanje virusov
- Bolezni, ki jih povzročajo virusi in protivirusna zdravila