Β-oksidacija je niz procesov, ki potekajo na ogljiku v Β do karbonila.
Prvi encim v procesu je "acil koencim A dehidrogenaza ki se nahaja na notranji mitohondrijski membrani in ima FAD kot kofaktor, ki se reducira na FADH2 in daje svojo redukcijsko moč koencimu Q (dihalna veriga); ta encim katalizira reakcijo, ki iz acil koencima A vodi v nastanek enoil koencima A (natančneje trans 2,3 enoil koencima A), ki je nenasičen sistem α-Β (alken). Drugi encim b-oksidacije ali je "enoil koencim A hidrataza ki pretvori enoil v L-Β hidroksi acil koencim A; ta encim je popolnoma stereospecifičen za izomer L-Β hidroksi acil koencima A.
Naslednjo reakcijo katalizira L-Β hidroksi acil koencim A dehidrogenaza (Encim, odvisen od NAD), ki pretvori L-Β hidroksi acil koencim A v b-keto acil koencim A; hkrati pride do zmanjšanja NAD + na NADH.
Nazadnje se vmeša eden tiolaza (b-keto acil koencim A tiolaza); reakcija zahteva tudi litično sredstvo, ki ga predstavlja koencim A: nastane fragment z dvema atomoma ogljika (tj. "acetil koencim A"), preostali ogljikov ogrodje pa predstavlja acil koencim A (v primerjavi z začetnim je izgubil dva atoma ogljika ).
Acil koencim A, pridobljen z Β-oksidacijo, postopek ponavljamo, dokler ne dobimo samo acetil koencima A.
Skoraj absolutno pravilo: ko pride do dehidrogenacije med dvema sosednjima atomoma z jasno razliko v afiniteti do elektronov, je kofaktor encima dehidrogenaze skoraj vedno NAD, medtem ko je dehidrogenacija med dvema sosednjima atomoma, vključno s c, majhna razlika v afiniteti elektronov , kofaktor je FAD.