Odporni sevi mikrobov lahko:
- Proizvaja encime za spreminjanje zdravil (na primer beta-laktamaze);
- Spremenite strukturo, na katero zdravilo deluje;
- Uporabite presnovno linijo, ki ni zavirana;
- Spremenite prepustnost celic in preprečite prehod ali adhezijo molekule z antibiotičnim delovanjem.
GENE R, ki prenaša odpornost na antibiotike, najdemo v plazmidih in zlasti v TRANSPOZONIH (zato lahko transpozon najdemo v plazmidu, lahko pa ga vključimo tudi v kromosom odporne bakterije).
Za dodatne informacije glejte namenski članek: Bakterije: genetika in mehanizmi prenosa genskih informacij
organizma, ki ga običajno sestavlja GRAM -. Upoštevati je treba tudi, da sam antibiotik ne ustvarja odpornosti (ki izhaja iz mutacij in prenosa genov), ampak jo izbere.Po drugi strani pa odpornost ni pojav prilagajanja na antibiotik, ampak dogodek - spontan in prenosljiv -, ki vpliva na genetsko dediščino bakterije.
Za izbiro najprimernejšega antibiotika v vsaki situaciji je treba bakterijo izolirati z uporabo ustreznih analiz in testov (vzorčenje z brisi, biopsijami itd.). Nato se bakterije razmnožijo v ustreznih gojiščih; nato različne antibiotike preizkusimo z metodo, imenovano antibiogram.
Bakterije se nato razširijo (tehnični izraz platirano ali inokulirano) v petrijevko, ki vsebuje agarni medij (trden), znotraj katerega so razporejeni vpojni papirni diski (imenovani bibula). Vsak od teh diskov je namočen v določen antibiotik. Po 24 urah se oceni rast bakterij okoli diska: večji kot je polmer inhibicije, učinkovitejši bo ta antibiotik.
Obstajata dve vrsti antibiogramov, ena posredna in ena posredna. Prvi se izvaja neposredno na patološkem materialu in ima veliko pomanjkljivost, ker ni selektiven (vemo, da je bil določen antibiotik bolj ali manj učinkovit od drugega pri zmanjševanju mikrobne populacije, vendar ne vemo, kako aktiven je proti en sam patogen). Pri posrednem pa je patogen najprej izoliran iz vzorca in različni testi se izvajajo le na njem.
Za preprečitev pojava odpornosti na antibiotike je pomembno tudi sodelovanje bolnika, ki mora nadaljevati terapijo do časa, ki ga določi zdravnik, ne da bi ga prekinil - kar se pogosto zgodi - pri prvih znakih izboljšanja.