S kemijskega vidika je fondaparinuks sintetični sulfatni pentasaharid, katerega kemična struktura temelji na aktivnem delu nefrakcioniranega heparina.
Podobno kot druga zdravila s heparinom je treba fondaparinuks dajati parenteralno, zlasti s subkutano injekcijo, da deluje. V nekaterih primerih pa lahko zdravilno učinkovino intravensko injicira tudi specializirano zdravstveno osebje.
V Italiji je fondaparinuks na voljo v enem samem zdravilu, imenovanem Arixrtra®. Zdravilo je v obliki raztopine za injiciranje, pripravljene za uporabo, v napolnjenih injekcijskih brizgah. Za izdajo tega zdravila je potreben zdravniški recept. ponovljivo; ker pa je razvrščeno kot zdravilo razreda A, lahko njegove stroške (zagotovo visoke) povrne nacionalni zdravstveni sistem (NZS).
