PH blata je običajno nevtralen ali rahlo alkalen (6,8 - 7,5). Bolj kislo blato, fiziološko samo pri novorojenčku, lahko kaže na črevesne okužbe (Escherichia coli, rotavirus) ali prebavne motnje, kot sta intoleranca za laktozo ali maščobe (steatorreja zaradi insuficience trebušne slinavke ali zastoja žolča).
Na pH blata vplivajo prehranske navade osebe; na primer prehrana, ki je pretirano bogata z mesom in mlečnimi izdelki, naredi blato bolj alkalno. Gniloba črevesne bakterijske flore pravzaprav uničuje aminokisline, ki so se izognile absorpciji, pri čemer nastajajo strupeni in smrdljivi amini; posledično se pH iztrebkov zaradi povečane proizvodnje amoniaka poveča. Zato ni naključje, da je preveč alkalni fekalni pH, ki ga spremlja zmanjšanje kratkoverižnih maščobnih kislin (glej butirat), povezan s povečanim tveganjem za kolorektalni rak.
Če se pH iztrebkov v prisotnosti gnilobene disbioze nagiba k povečanju, se v prisotnosti fermentacijske disbioze ponavadi znižuje, katere vzroke je treba iskati v prekomernem zaužitju ogljikovih hidratov ali v slabi absorpciji le -teh ( celiakija). Tudi v prisotnosti "obilnega vnosa lipidov, pri vegetarijanski prehrani in pri daljšem postu se pH blata zakisa.
Da bi se izognili popačenju rezultatov testa, blato ne sme biti kontaminirano z urinom in ga je treba hitro ohladiti, da se prepreči, da bi amoniak in gnile bakterije v urinu naredile alkalni pH v blatu.